El nitrógeno es importante para la Bahía porque estimula el crecimiento de las plantas. Sin embargo, el exceso de nitrógeno puede ocasionar una proliferación de algas, que pueden agotar el oxígeno en el agua y acabar con la vida marina. En el año 2018, las concentraciones de nitrógeno en las vías navegables regionales estuvieron por encima del estándar estatal en el un por ciento de las muestras tomadas en la Bahía de Galveston y en 12 por ciento de las muestras tomadas de los ríos y bayous que rodean la bahía de Galveston.

La mayoría de las cuencas en la región de la Bahía de Galveston reciben una calificación A. Sin embargo, algunas de las cuencas más urbanizadas de la región (Los lagos Addicks y Barker,  y Sims Bayou) recibieron la calificación de B.

El fósforo, al igual que el nitrógeno, es un nutriente que estimula el crecimiento de las plantas. Sin embargo, demasiados nutrientes pueden generar brotes de algas, que merman el oxígeno en el agua y acaban con la vida marina. En 2018, las concentraciones de fósforo estuvieron por encima de los niveles de monitorización estatal en el 28 por ciento de las muestras tomadas en la Bahía de Galveston y en el 41 por ciento de las muestras tomadas de los ríos y bayous que rodean la Bahía.

Muchas cuencas del sur y del este de la región de la Bahía de Galveston obtienen una calificación de A. Sin embargo, las cuencas de las regiones más urbanizadas, que se extienden desde Clear Creek hacia el norte de la rama oeste del rio San Jacinto en el condado de Montgomery continúan recibiendo calificaciones de B, C y D con el lago Barker recibiendo la menor calificación de F. Estas cuencas reflejan algunos de los usos de las tierras urbanas más pobladas de la región, dando lugar a volúmenes más grandes de escorrentía de lluvia que fluye desde patios, estacionamientos y calles.

Así como las personas necesitan oxígeno para respirar, se requieren niveles adecuados de oxígeno en el agua para dar sustento a la vida marina en la Bahía de Galveston y en los bayous de la zona. Las zonas de hipoxia (poco oxígeno) y anoxia (ausencia de oxígeno) son comunes después de grandes brotes de algas en aguas cálidas, quietas y poco cristalinas. Los bentos (especies demersales) no pueden escapar ni sobrevivir en condiciones hipóxicas. En el año 2018, los niveles de oxígeno disuelto estuvieron por debajo de los niveles de monitorización estatal solo el dos por ciento de las muestras tomadas en la Bahía de Galveston y en 11 por ciento de las muestras tomadas de los ríos y bayous que rodean la Bahía. En consecuencia, toda la Bahía de Galveston y sus cuencas continúan recibiendo una calificación A por oxígeno disuelto. Esta es una buena noticia para la Bahía y para sus poblaciones de peces y crustáceos.