Las bahías y los estuarios son cuerpos de agua en los que los ambientes marinos y de agua dulce se entremezclan. El ecosistema de la Bahía depende del agua dulce que fluye aguas abajo desde los ríos, bayous y arroyos. La cantidad y la ubicación temporal del caudal afluente de agua dulce están directamente relacionadas con la ) hasta marina (35 PSU) y depende de las mareas, el momento y la locación de la lluvia.»]salinidad, la disponibilidad de nutrientes para impulsar la red alimentaria y la disponibilidad de sedimentos que apoyan los hábitats de la Bahía.

En promedio, la región de Houston-Galveston recibe entre 40 y 50 pulgadas de lluvia cada año. Sin embargo, la región sufrió una sequía extrema entre el 2010 y el 2012, con condiciones extremadamente secas en el año 2011. En el 2015 y 2016, las tasas de precipitación estuvieron de nuevo por encima del promedio, con inundaciones importantes en mayo y abril de esos años respectivamente. Las tasas de lluvia de 2017 establecieron récords debido al huracán Harvey, y el 2018 tuvo caudales afluentes aún mayores.

En 2022, lanzamos un nuevo sistema de clasificación para caudales afluentes de agua dulce. Está claro que la vida silvestre de la Bahía de Galveston se ve afectada por los eventos de flujo extremo bajo y alto.  El uso del agua y la variabilidad del clima pueden resultar en eventos de flujo extremadamente bajo y flujo extremadamente alto durante el mismo año. Con el fin de capturar esa variabilidad y la amenaza a los caudales afluentes de agua dulce en la región, ahora se calculan tanto eventos de flujo bajo como de alto flujo, y se agrupan en tres años de datos mensuales, en comparación con el período de registro (1940-2022, el año de datos más reciente).  Los gráficos a continuación representan las calificaciones basadas ​​en la frecuencia de eventos de flujo muy alto y muy bajo, agrupados en intervalos de tres años. Para el período de 2017-2019, los eventos de flujo bajo recibieron una calificación de A y los eventos de flujo alto recibieron una calificación de D. Los años de flujo extremadamente alto (como 2014-2016) recibieron una calificación F para flujo alto y una calificación de B para flujo bajo.  La última gran sequía de Texas (2010-2013) resultó en calificacion de flujo bajo de D para 2011-2013.  Como referencia, los años históricos de sequía de 1950-1957 recibieron calificaciones de caudales afluentes de agua dulce de bajo flujo de D, F y F para 1949-1951, 1952-1954 y 1955-1957.

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El aumento relativo del nivel del mar es la combinación de hundimiento del suelo con el aumento de los niveles del océano. Los aumentos del nivel del mar afectan hábitats costeros importantes, así como a comunidades humanas. La larga historia de aumento del nivel del mar en la Bahía de Galveston, la subsidencia, las mareas de tempestad e inundaciones hacen del nivel del mar un asunto de preocupación crítica.

La calificación por el aumento del nivel del mar continúa siendo una F. En promedio, el nivel del mar ha aumentado dos pies durante los últimos 100 años en el Muelle 21 en Galveston y se espera que esa tendencia continúe. Las ciudades costeras alrededor de Estados Unidos, como Miami Beach en Florida, Wilmington en Delaware y Annapolis en Maryland ya están enfrentando inundaciones costeras crónicas y están buscando formas de adaptarse y volverse más resilientes.

Las temperaturas del agua en el invierno representan el rango más bajo de temperaturas que las plantas y los animales deben superar para vivir en la Bahía. A medida que los cambios en el clima afectan las temperaturas del agua, especies de plantas y animales se trasladan a nuevas áreas donde antes no se les encontraban. Las temperaturas del agua de la Bahía en invierno, desde diciembre hasta febrero han vuelto al rango esperado en 2023, en contraste con 2022, cuando las temperaturas del agua en invierno fueron un diez por ciento más altas que los valores promedio de los 15 años anteriores. Las temperaturas del agua de la bahía en invierno podría tener implicaciones para las especies nativas, las especies invasoras, las bacterias y los niveles de oxígeno en la bahía.

La acidez o la alcalinidad del agua se miden mediante valores de pH. Entre más bajo sea el pH, mayor es la acidez. Dado que el pH de la Bahía de Galveston está determinado por la mezcla de agua salada del Golfo de México y de agua dulce de los ríos y bayous de la cuenca, los cambios que ocurran en cualquiera de las fuentes pueden ocasionar un impacto. Los valores de pH en la Bahía se mantienen dentro de un rango apropiado para la vida marina, obteniendo una calificación A.