La basura es un contaminante abundante en la Bahía. Los plásticos son particularmente nocivos para los animales que los ingieren, por cuanto ocasionan desnutrición, exposición tóxica e incluso la muerte. A pesar de que los desperdicios y basura están ampliamente identificados como problemas serios para la Bahía de Galveston y sus afluentes, no existe un control sistemático en la Bahía para reducir esta clase de contaminación. Las evaluaciones para determinar las vías y áreas de entrada de desperdicios a lo largo de la Bahía y costas de bayous podrían ayudar muchos en establecer las mejores prácticas para reducir la contaminación por desperdicios en el futuro. Se está trabajando mucho para mejorar el control y la eliminación de basura y desechos de la Bahía de Galveston y su cuenca