La acidez o la alcalinidad del agua se miden mediante valores de pH. Entre más bajo sea el pH, mayor es la acidez. Dado que el pH de la Bahía de Galveston está determinado por la mezcla de agua salada del Golfo de México y de agua dulce de los ríos y bayous de la cuenca, los cambios que ocurran en cualquiera de las fuentes pueden ocasionar un impacto. Los valores de pH en la Bahía se mantienen dentro de un rango apropiado para la vida marina, obteniendo una calificación A.